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Ce travail a pour objectif d'analyser la mise en place des réseaux karstiques et de l'organisation du drainage souterrain dans le cas des karsts de plateau à travers le prisme des poljés. La méthodologie combine des approches de i) morphologie de surface, ii) de spéléogénèse et iii) d'hydrogéologie. Le site d'étude est le bassin de la Haute-Loue dans le massif du Jura (France), typique de karsts de plateaux, avec son haut potentiel de karstification (une centaine de réseaux karstiques de plus de 100m, de nombreuses sources karstiques au débit moyen de plusieurs m3/s) et sa bonne connaissance hydrogéologique (plusieurs centaines de traçages artificiels). Tout d'abord, une cartographie morphologique de surface détaillée a permis de mettre en évidence que les plateaux actuels correspondent à d'anciennes dépressions à fond relativement plat, elliptique, de grande étendue (~ 400 km²) comprises entre des barrières hydrologiques en relief que sont les faisceaux (anticlinaux chevauchants). Ces dépressions, interprétées comme des paléo-poljés, sont aujourd'hui perchées à 150 m au-dessus du niveau de base actuel (fond du canyon de la Loue) et n'ont plus qu'un fonctionnement hydrologique résiduel. Ensuite, l'analyse des traçages artificiels au sein des hydrosystèmes karstiques majeurs actuels a permis de préciser l'extension de leurs bassins d'alimentation. Une importante corrélation spatiale entre la géométrie de ces bassins actuels et les paléo-poljés semble indiquer que les paléo-poljés ont pré-structuré le drainage souterrain de la zone d'étude. Enfin, l'analyse des galeries horizontales (hauteur relative et formes endokarstiques) montre plusieurs niveaux marqués et des morphologies de paragénèse fréquentes. Cette organisation particulière des karsts de plateau est probablement reliée au fonctionnement hydrologique des paléo-poljés (régulières et longues périodes d'ennoiement). Nos résultats permettent de proposer un premier modèle conceptuel karstogénétique et hydrogéologique de la mise en place des karsts de plateau du massif du Jura.